二者虽然在会计科目的设置、会计报表的内容格式上基本一致，但二者之间还有很大的差别。
在账务处理上的主要差异：
①存货核算方面的差异。
②成本费用核算方面的差异。
工业企业的成本核算方法主要包括个别计价法、品种法、分批法、分步法等。施工企业的成本核算方法主要采用项目法。商业企业成本核算方法则比较特殊，一般采用零售价法。
在成本结转方法方面，工业企业的成本结转是在产品与产成品之间分配其各自的成本，因此成本结转方法包括不计在产品成本、固定计算在产品成本、约当产量法等。施工企业在项目完工前没有产成品，因此对在产品的成本结转主要根据配比原则，按照收入实现的完工百分比确认成本。
③收入核算、管理方面的差异。
④货币资金与往来款项方面的差异。
⑤固定资产核算方法的差异。
拿工资来说;工业计提时
借:制造费用
管理费用
营业费用
贷:应付工资
借:生产成本
贷:制造费用
发放时借:应付工资
贷:现金
商业计提时
借:管理费用
营业费用
贷:应付工资
到月底结转都是把费用结转到本年利润的借方
这就需要会计在实际应用中要灵活运用,根据企业自身的经营情况,应分别处理:
