税务机关、纳税人和中介机构在税务处理中，往往因为对税务处理涉及的多层次法律确认不够，从而产生税务风险。按照次序，税务处理可以细化为六个层次的法律确认。
税务处理是税务行政执法、纳税义务履行、税务中介机构执业的行为，其任务是保证税务处理的行为合法，防范税务处理的违法风险。税务处理涉及多层次的法律确认，按照税务处理的次序，可以细化为六个层次的法律确认：一是交易行为事实的确认，二是业务核算、会计核算、统计核算证据证明的确认，三是交易法律关系的确认，四是交易适用法律依据的确认，五是税收权利义务的确认，六是违法责任的确认。
交易行为事实的确认
纳税义务以交易行为事实为基础，只有发生了税法规定交易行为的主体才是纳税义务人，不存在没有行为事实的税收主体。因此，交易行为事实的确认是税务处理的起点，包括民法事项确认和行政法事项确认。
交易事实的确认，应避免事实证据的不可逆转或客观不可能风险。如企业不动产对外投资，在办理过户前交易是可以选择的，办完过户后则属于不可逆或不可能事项，即使发现了税收风险再反过户则属于第二次交易。一项交易如果是国家没有设定行政监管程序的交易，属于一般市场交易活动，民法上称为非要式交易;如果设有行政监管程序的交易，则属于要式交易。如不动产交易实行先税后证制度，过户程序是法定的市场监管程序，未履行过户程序，交易无效。又如股权交易国家设定了登记程序，未履行登记程序，交易无效。
交易事实证据证明的确认
交易事实必须是有证据证明的事实，完成交易行为事实确认后，进入了第二层次的法律确认——交易事实的证据证明确认。税务处理人应遵循民法证据制度、行政法证据制度、刑法证据制度，通过交易业务核算、会计业务核算、统计核算的有关信息资料收集，取得具有合法性、相关性、真实性的证据。需要强调的是，证据事项是以三个核算为基础的，会计核算资料并不是证据的唯一来源，业务核算和统计核算是税务处理证据的重要来源。因为，会计核算的对象是资金运动的事后反映和监督，并不能替代税务处理所需要的统计核算资料和业务核算资料。
证明过程要解决六个交易事实问题：谁在交易、是什么交易、怎么交易、交易对价、交易时间、交易的金额和数量。
