8月25日，海协会与台湾海基会恢复协商后的第11次会谈在福州举行，双方签署了《海峡两岸避免双重课税及加强税务合作协议》。
9月7日，国税总局港澳台办公室有关负责人就协议答记者问指出，两岸税收协议通过规定合理的协议税率，为两岸企业创造了优惠及具有竞争力的投资环境;明确税收抵免规定和方法，有效地消除重复课税现象，切实降低两岸经贸往来中企业与个人的税收负担。
据21世纪经济报道记者采访了解，该协议基本比照OECD范本，在征税权划分上，多让渡给居民国，即征税权多赋予投资国。
目前而言，台湾对大陆投资额要大于大陆对台湾投资额，即台湾当局和在大陆投资的台商等将更多获益。据媒体报道，台湾相关部门预测，协议签订后，大陆台商每年可省下的税金将高达39亿元新台币。
海峡两岸协定基本享受了最优惠的待遇。其中，在财产收益部分，即股权转让方面，只要转让公司不动产占比不超过50%，可在被转让公司所在地免税，这个条款为目前我国签署税收协定中最为优惠的规定。
该协议仍要通过两岸法定程序，若顺利通过，将于2016年元旦正式生效。
台商减负
海峡两岸税收协定的签署，这将减少重复征税，减轻台商负担，进一步活跃两岸经贸投资往来。
仅厦门一地，预测协议签订后，将每年为在厦台商及台籍人员减轻税负超2000万元。
协议生效后，台湾机构来大陆经营不构成常设机构，无需在大陆缴纳企业所得税，免除了复杂的境外税收抵免程序。大陆企业所得税率基本为25%，台湾的营利事业所得税率一般为17%或20%，大陆相对较高的税率，协议生效后，也能使得相关企业税负下降。
协议规定，“一方居民(居住者)企业在另一方营业取得的利润，在未构成常设机构的情况下，另一方予以免税或不予课税”。如建筑工地、建筑(营建)或安装工程或与其有关的监督管理活动，以存续期间超过十二个月者，构成常设机构;提供咨询服务等，需在有关纳税年度开始或结束的任何12个月连续或累计超过183天者，构成常设机构。
竞天公诚律所合伙人马骋对21世纪经济报道记者表示，未签署协议前，中国大陆有权对任何在境内开展经营的企业征税;签署协议后，税收协定法律效力要高于本土法，非常设机构将免于在来源国征税。另外，签署协议前虽有税收抵免政策，但若来源国税负较重，相较居民国高出的税负并不能退还。
多项最惠待遇
据国税总局，截至2015年8月底，我国已对外正式签署100个避免双重征税协定，其中97个协定已生效，和香港、澳门两个特别行政区签署了税收安排，与台湾签署了税收协议。
这100个税收协定，包括了世界主要经济体。近几年与欧洲一些主要国家，如德国、法国、英国等重新签订了新的协定，与香港的协定也是第二个。虽与台湾的协定来得晚了些，但给的待遇基本是最优惠的。
如股息、利息和特许权使用费。根据各自本土法，从大陆支付给台湾企业的扣缴税率一般为10%，从台湾支付给大陆企业的税率一般为20%或15%。协议生效后，股息方面，若持股比重超过25%，适用5%的优惠税率，其他情况适用10%的税率;利息方面，适用7%的优惠税率;特许权使用费方面，适用7%的优惠税率。
再如，协定规定“一方海、空运输企业在另一方经营取得的收入及利润，另一方予以免税或不予课税(包括营业税、增值税或类似税收)”。对于海运及空运收入，我国与其他国家签署的协议中，有些是免除企业所得税，有些是免除如营业税、增值税等的间接税，与台湾的协定则是既免除了所得税，也免除了间接税。普华永道指出，该优惠待遇将有助于两岸继续拓展直航业务。
另外，对于财产收益方面，协定规定“转让其他股权，一般由居民地征税，除非居民地对该项收益免税，且在转让前12个月内，转让方曾直接或间接持有另一方公司至少25%股份”。
此处的规定，多了一个“除非居民地对该项收益免税”，这是在以往我国签署的协定中从未出现过的。普华永道指出，大陆和台湾的本土法对股权转让收益免税的规定极为罕见，因此，在《协议》此项规定下，只要被转让公司不动产占比不超过50%，就可在被转让公司所在地免税。与大陆和其主要投资来源地签订的税收协定相比，《协议》在这方面的规定是最为优惠的。
马骋也表示，“除非居民地对该项收益免税”这个前提很特别，在近几年新签署的协定中未曾看见过。这个应该是给台湾方面的优惠，因为双方直接投资中还是台湾到大陆的比较多。
